Die Makkaroni in Salzwasser nicht zu weich kochen, abgießen, kalt abbrausen und in einem Sieb abtropfen lassen. Das Fleisch kalt abbrausen, mit Küchenpapier trockentupfen und in mundgerechte Würfel schneiden. Die Zwiebel und den Knoblauch schälen und fein würfeln. Das Öl in einem Topf erhitzen und die Zwiebel- sowie die Knoblauchwürfel darin glasig braten. Das Fleisch zugeben, unter Wenden anbraten und anschließend die heiße Fleischbrühe zugießen. Alles zusammen etwa 6 Minuten schmoren lassen.
Inzwischen den Backofen auf 200°C (Gas Stufe 2-3) vorheizen. Die Tomaten in kochendes Wasser tauchen, kurz abschrecken und häuten. Das Fruchtfleisch würfeln. Die Zucchini unter fließendem Wasser abbürsten, abtrocknen, von Stiel- und Blütenansatz befreien und in Scheiben schneiden. Das Öl in einer Pfanne erhitzen und die Zucchinischeiben darin von beiden Seiten leicht anbraten. Mit dem Thymian bestreuen.
Die gehackten Kräuter und das Salz unter die Fleisch-Zwiebel-Mischung rühren. Das Öl aus der Zucchinipfanne in eine backofengeeignete Auflaufform tropfen lassen, verteilen und lagenweise Makkaroni, Fleisch-Zwiebel-Masse, Tomatenstücke und Zucchinischeiben einschichten. Mit einer Schicht Makkaroni abschließen und den geriebenen Käse darüber streuen. Den Auflauf im vorgeheizten Backofen 20-30 Minuten überbacken. Mit Petersilie bestreut servieren.
